可報考國內各大學生命科學相關研究所，包括：生命科學所、生物科技所、生物醫學資訊所、神經科學所、生物工程所、生物化學所、分子生物所、遺傳所、藥理學所、基礎醫學所、解剖學及細胞生物學所、微生物及免疫學所、動物所、植物所、生態所、海洋生物所、野生動物保育所、漁業所、農業化學所、法律及鑑識科學所等。(研究所考取狀況)
 

通過TOEFL(或IELTS)、GRE或日文檢定後，可申請赴國外各大學生命科學相關研究所深造。

(111學年本系畢業學生有43.8%繼續攻讀研究所)

在學界方面:

系友分布在各大學院校及研究機構，擔任教職或研究員。包含台灣大學國際學院、國立海洋大學食品科學系、陽明交通大學生物科技學系、成功大學生物科技產業科學系、清華大學生物科技研究所、台北醫學大學、中國醫藥大學醫學院醫學系、嘉南藥理大學環境資源管理系、國立中山大學 海洋生物科技暨資源學系、臺灣師範大學生命科學系、嘉義大學水生生物科學系、中國文化大學生命科學系、森林暨自然保育學系、園藝暨生物技術學系。

在業界方面:

系友在產業界擔任高階職務或負責人，如聯亞生技開發股份有限公司、基龍米克斯生物科技(股)公司、格園社會企業有限公司、酷氏基因生物科技股份有限公司、方舟智慧股份有限公司、臺灣生醫科技股份有限公司、Leica Microsystems (徠卡顯微系統公司)、蟹兒創意有限公司、Ray Chin Images影像工作室等等。系友在產業界表現受到肯定，且不定時返校與在校生座談或提供實習機會。